著者は、投稿プロセスの第4ステップで補足ファイルをアップロードすることができます。補足ファイルには、研究データセットや研究装置、ソーステキスト、投稿物の付録ではあるが、それ独自の価値があり独立の文書して扱ったほうが良いその他の資料を含めることを意図しています。さらに、著者は、投稿物とは独立に補足ファイルをインデックス化することにより、大規模なインデックスに補足ファイルを組み込み、これらの特定の種類のアイテムを探している人々に発見されるようにすることができます。

補足ファイルフォーマット: 標準的な原稿フォーマットでなければならず、標準的な出版フォーマットに変換されることになる投稿物とは対照的に、補足ファイルのフォーマットには制約はなく、オリジナルのファイルフォーマットでアップロードされ、そのままのフォーマットで保管されます。これは、スプレットシートの形態のデータセットやFlash文書をアップロードすることができ、そのままのフォーマットで保存されることを意味します。これは読者にとって問題をもたらすかもしれません。著者はこれを考慮して、補足ファイルの説明や補足ファイルを開いて読むために自由にダウンロードできるソフトウェアを見つけることができる場所などを提供する必要があります。