レイアウトエディタは、原稿整理された投稿物を変換して、雑誌が選択したHTML、PDF、PSなどの電子出版用のファイルフォーマットのゲラを作成します。このシステムは、ワープロ文書をゲラフォーマットに変換するソフトウェアを提供していません。したがって、レイアウトエディタは、ゲラを作成するサードパテーティ製のソフトウェア（例えば、PDFフォーマットにはAdobe Acrobat、HTMLにはDreamweaverなど）を利用できなければなりません。これらのソフトウェアを使って、（他のオンライン出版者、例えば、生命科学分野のHighwire Pressや人文科学のProject Museで使用されているレイアウトを参考に）学術雑誌の様式に合わせ、またこの新しい出版メディアを考慮して、論文を適切にフォーマットし、読みやすいレイアウトで画面に表示します。